La micropaléontologie a pour objectifs d’étudier les microfossiles, c’est-à-dire le plancton fossilisé, parmi lesquels on trouve les foraminifères, les radiolaires, les diatomées… assez communs et qui peuvent e l’on retrouve sur l’ensemble des ères géologiques, du Précambrien à l’Holocène. C’est l’équipe du laboratoire de Roscoff, menée par Colomban de Vargas, qui réalise les analyses de micropaléontologie. En comparant les échantillons de plancton prélevés pendant Tara Oceans avec les microfossiles, ils essaient de déterminer l’évolution du plancton à l’échelle des temps géologiques.